Struktur organisasi merupakan suatu susunan dari berbagai macam komponen atau unit kerja dalam sebuah organisasi dimana terdapat pembagian kerja dan bagaimana fungsi atau kegiatankegiatan berbeda yang dikoordinasikan, dan juga terdapat adanya berbagai spesialisasi dari sebuah pekerjaan, saluran perintah ataupun penyampaian laporan.

Bagan organisasi dan tata kerja Poltekpel Barombong berdasarkan Peraturan Menteri Perhubungan RI Nomor PM 29 Tahun 2019 tentang Organisasi dan Tata Kerja Politeknik Pelayaran Barombong.